《聖經》，從創世紀到啟示錄，是基督科學的教義和實踐的基礎。就像創世紀第一章所說，我們是按神的 “形像和樣式” 而創造的，耶穌的傳道向我們展示如何通過祈禱而了解我們的本質是靈性的。 《聖經》裡有關耶穌弟子及追隨者的故事，以及舊約全書裡有關亞伯拉罕、雅各布及摩西及其他先知的故事，都是療癒的例子。
瑪麗·貝格·愛迪認為，基督科學是受《聖經》啟發而得到的深刻靈性認知，也就是靈性療癒背後的神聖律法。這些不朽的律法影響到每一個人，其目的在於療癒、拯救及造福每一個人。她的著作《科學與健康》包含 “聖經之鑰匙” 的字眼，代表著《科學與健康》和《聖經》有不可分割的關係。描述基督科學時，她寫道，“《聖經》是我唯一的典據”，及 “《聖經》包含著所有療癒的配方”（《科學與健康》，126，406 頁）。基督科學有六個主旨，第一個主旨是：“作為 真理的信徒，我們以《聖經》的啟示之 道作為我們達至永恆 生命的充分指引”（《科學與健康》，497 頁）。
每週的聖經課程提供自修的機會，是星期日禮拜的核心。主日學的學生都在 20 歲以下，其課程的基礎是《十誡》、《主禱文》及《登山寶訓》。星期三見證聚會的參與者朗讀聖經引文，並分享如何把聖經課程的意義應用在日常生活裡。